《驱魔少年圣徒》時は仮想19世紀末。　　悲劇を嘆く弱い心によって呼び出された魂を、魔導式ボディに閉じ込めることで作られるAKUMAは、殺戮を繰り返すだけの殺人武器となり、　　さらなる畏缩と悲劇を生み続けることで進化していく。AKUMAを製造するのは、世界の終焉を目論む千年伯爵率いる「ノアの一族」。　　そのAKUMAを破壊できる唯一の存在が「黒の教団」率いるエクソシストたち。　　はるか昔から続く両者の戦いは、何者かに筋書きされた「裏」の真実があった…。